Développements bioinformatiques en métagénomique


Bio-Informaticien/ne

Missions:

Dans le cadre de l’expansion des activités de la société, Vaiomer recherche un bioinformaticien. Le candidat sélectionné aura pour principale mission de prendre en charge les développements
bioinformatiques des projets de métagénomique.

Ces missions incluent le développement de pipelines bio-informatiques, l’accompagnement de la mise en place du système d’assurance qualité, l’interaction avec les scientifiques de l’entreprise et les fournisseurs de séquençage NGS, la réalisation des analyses bioinformatiques pour les clients et la veille scientifique et technologique.

Le candidat sera notamment impliqué dans le développement d’interfaces graphiques web pour permettre aux biologistes d’utiliser les outils bioinformatiques, de visualiser puis de valider les résultats de façon autonome.


Profil:

Le candidat devra être titulaire d'un Master en bioinformatique et avoir au moins 2 années d’expérience dans le développement d’outils bioinformatiques. D'excellentes connaissances appliquées sont requises en développement logiciel et web pour créer et interfacer des outils bioinformatiques, notamment avec une base de données et un système informatique de laboratoire.

Des connaissances en analyse de données NGS, métagénomique, métabolomique et/ou en génomique seront appréciées. Le candidat devra avoir une excellente capacité à travailler en équipe, à communiquer, et faire preuve d'autonomie dans son travail.



Compétences clefs recherchées:

  • Double compétence Biologie / Informatique

  • Compétences techniques :

    • maîtrise du développement objet en langage Python

    • développement d’interface web (Framework web type Django, Javascript)

    • Travail en ligne de commande sous GNU/Linux

  • Compétences générales :

    • gestion de projet et reporting

    • capacité à travailler en équipe dans un environnement
      pluridisciplinaire

    • anglais scientifique et technique


Compétences additionnelles souhaitables:

  • Maîtrise d’un ORM (type SQLAlchemy)

  • Conception et modélisation logicielle objet (UML)

  • Analyse de données de métagénomique, métabolomique, génomique

  • Analyses statistiques de données


Pour postuler, merci de faire parvenir votre lettre de motivation et votre CV au responsable bioinformatique Florence Servant :
florence.servant@vaiomer.com