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Job Description:
Additionnal Informations:

Vaiomer est une entreprise de biotechnologies et CRO située à Labège (Toulouse), experte dans le domaine du microbiote tissulaire.

Grâce à son expertise, Vaiomer a découvert l’existence d’un microbiote tissulaire et utilisé ce nouveau concept pour identifier des biomarqueurs cliniques et des cibles pour les industries pharmaceutiques et agroalimentaires.

Nous avons notamment révélé la présence d’un microbiome sanguin très diversifié chez le sujet sain, et montré l’association entre modification de ce microbiome sanguin et plusieurs maladies cardiométaboliques, telles que l’obésité, le diabète de type 2 ou la fibrose du foie.

Chez l’homme et la souris, l’étude du microbiote tissulaire et de son interaction avec le système immunitaire permet également la validation et la découverte de nouveaux compléments alimentaires telle que prébiotiques et probiotiques

Pour étudier le lien entre ces maladies et les bactéries présentes dans les tissus, Vaiomer utilise entre autres des techniques de séquençage métagénomique haut débit (16S targeted Metagenomics) avec la technologie Illumina Miseq et de quantification de l’ADN bactérien par qPCR 16S.

Missions :

Nous recherchons un Technicien Biologie Moléculaire, séquençage haut débit. Sa mission sera d’assister notre équipe scientifique pour :

1-Réaliser nos productions scientifiques contractuelles pour le client : effectuer l’extraction d’ADN/ARN à partir d’échantillons de tissus variés, la préparation des librairies de séquençage, la gestion des runs de séquençage, et l’analyse qPCR 16S.

2-Participer à nos recherches et développements technologiques et scientifiques.

3-Participer à la vie du laboratoire à travers la veille technologique, l’amélioration de protocoles, l’implication dans les démarches d’assurance qualité.

Le poste implique de nombreuses interactions avec les différents membres de l’entreprise (chercheurs, ingénieurs, techniciens, bioinformaticiens, directrice commerciale, responsables qualités, …) ainsi qu’avec des collaborateurs extérieurs.

Profil du candidat :

Nous recherchons une personne rigoureuse, dynamique, motivée, et sachant travailler en équipe pour travailler et évoluer au sein d’une entreprise dans laquelle elle pourra mettre en valeur ses compétences et apprendre de nouvelles techniques.

Le candidat (niveau bac+2/bac+4 en biologie) devra obligatoirement avoir une expérience poussée en biologie moléculaire (extraction, manipulation d’acides nucléiques, PCR, qPCR, analyse sur gel …).

Une expérience précédente en analyse métagénomique ou séquençage haut débit serait un plus.

Une expérience en microbiologie, ainsi que dans la manipulation d’organismes pathogènes ou échantillons infectieux serait également appréciée.

Une connaissance basique de l’anglais est requise.

Permis de conduire et véhicule personnel indispensable (la plateforme de séquençage à 6 km de nos locaux).

Le poste à pourvoir sera un CDD d’un an, pouvant aboutir sur un CDI. Le salaire sera négocié en fonction de l’expérience et des compétences du candidat.

Pour postuler, merci de faire parvenir votre lettre de motivation et votre CV via "l'Application form" à gauche.

Job Description:
Additionnal Informations:


Bio-Informaticien/ne

Missions:

Dans le cadre de l’expansion des activités de la société, Vaiomer recherche un bioinformaticien. Le candidat sélectionné aura pour principale mission de prendre en charge les développements
bioinformatiques des projets de métagénomique.

Ces missions incluent le développement de pipelines bio-informatiques, l’accompagnement de la mise en place du système d’assurance qualité, l’interaction avec les scientifiques de l’entreprise et les fournisseurs de séquençage NGS, la réalisation des analyses bioinformatiques pour les clients et la veille scientifique et technologique.

Le candidat sera notamment impliqué dans le développement d’interfaces graphiques web pour permettre aux biologistes d’utiliser les outils bioinformatiques, de visualiser puis de valider les résultats de façon autonome.


Profil:

Le candidat devra être titulaire d'un Master en bioinformatique et avoir au moins 2 années d’expérience dans le développement d’outils bioinformatiques. D'excellentes connaissances appliquées sont requises en développement logiciel et web pour créer et interfacer des outils bioinformatiques, notamment avec une base de données et un système informatique de laboratoire.

Des connaissances en analyse de données NGS, métagénomique, métabolomique et/ou en génomique seront appréciées. Le candidat devra avoir une excellente capacité à travailler en équipe, à communiquer, et faire preuve d'autonomie dans son travail.



Compétences clefs recherchées:

  • Double compétence Biologie / Informatique

  • Compétences techniques :

    • maîtrise du développement objet en langage Python

    • développement d’interface web (Framework web type Django, Javascript)

    • Travail en ligne de commande sous GNU/Linux

  • Compétences générales :

    • gestion de projet et reporting

    • capacité à travailler en équipe dans un environnement
      pluridisciplinaire

    • anglais scientifique et technique


Compétences additionnelles souhaitables:

  • Maîtrise d’un ORM (type SQLAlchemy)

  • Conception et modélisation logicielle objet (UML)

  • Analyse de données de métagénomique, métabolomique, génomique

  • Analyses statistiques de données


Pour postuler, merci de faire parvenir votre lettre de motivation et votre CV au responsable bioinformatique Florence Servant :
florence.servant@vaiomer.com